Un estudo metaxenómico recente revelou un espectro notablemente diverso de virus e bacterias transmitidas por roedores na provincia de Heilongjiang, incluíndo o virus Lassa, o virus Amur, Salmonella e Yersinia pestis.
A investigación utilizou oKit de enriquecemento de ARN de patóxenos de Macro & Micro-Test, baseado na tecnoloxía de captura de sondas. Ao esgotar selectivamente o ARNr do hóspede e outros fragmentos conservados do hóspede, o método retivo eficazmente o ARN microbiano, mellorando significativamente a sensibilidade da detección de patóxenos. Este paso de enriquecemento de ARN do patóxeno foi fundamental para lograr unha alta taxa de detección e proporcionou un sólido apoio técnico para a vixilancia de patóxenos.
Roedores: reservorios clave de enfermidades zoonóticas
Os roedores son o grupo de mamíferos máis rico en especies e amplamente distribuído, comprendendo máis de 2.000 especies en todo o mundo e representando máis do 40% de todas as especies de mamíferos.
Ademais da súa importancia ecolóxica, os roedores serven como importantes reservorios e vectores de numerosos patóxenos zoonóticos.Dado que os hábitats dos roedores adoitan solaparse cos ambientes humanos (por mordeduras directas, contacto con excrementos ou transmisión indirecta a través de pulgas e ácaros), os patóxenos que albergan supoñen ameazas persistentes para a saúde pública.
Cabe destacar que máis do 70 % das enfermidades infecciosas emerxentes teñen a súa orixe na fauna salvaxe, e os roedores representan un dos reservorios virais máis importantes.
Rexión fronteiriza de Heilongjiang: unha liña de fronteira para a vixilancia de patóxenos
Heilongjiang, unha provincia fronteiriza no nordeste da China, posúe abundantes recursos ecolóxicos e comparte fronteiras con varios países. A combinación dunha rica biodiversidade e un frecuente movemento transfronteirizo de poboación crea condicións favorables para a transmisión de patóxenos.
Entre xuño e xullo de 2021, os investigadores recolleron 67 roedores salvaxes na cidade de Hengdaohezi, cidade de Mudanjiang. As mostras incluían:
l 20Apodemus penínsulae
l 47Myodes rufocanus
Todos os exemplares foron capturados en zonas residenciais e terras agrícolas circundantes, o que destaca a estreita interface entre os asentamentos humanos e os hábitats da fauna silvestre.
Tecnoloxía de enriquecemento de patóxenos: Superación da interferencia de fondo do hóspede
Na secuenciación metaxenómica, o ARN do hóspede domina normalmente as lecturas de secuenciación, enmascarando os sinais de patóxenos de baixa abundancia.
Para abordar este desafío, o estudo empregouKit de detección metaxenómica de patóxenos de Macro & Micro-Test. Usando a tecnoloxía de captura de sondas, as sondas deseñadas especificamente únense ao ARNr do hóspede e ás secuencias conservadas, o que permite o seu esgotamento e, polo tanto, enriquece o ARN microbiano.
Esta estratexia mellorou substancialmente a sensibilidade da detección de patóxenos, o que permitiu que a secuenciación posterior recuperase unha maior proporción de lecturas de patóxenos. O paso de enriquecemento sentou unha base sólida para caracterizar con precisión o espectro de patóxenos transportados polos roedores.
Tras o enriquecemento, as mostras de ARN sometéronse a transcrición inversa, construción de bibliotecas e secuenciación de alto rendemento. A análise bioinformática incluíu:
l Filtrado do xenoma do hóspede
Clasificación taxonómica mediante Kraken2
l Corrección de abundancia con Bracken
Este fluxo de traballo xerou un perfil completo das comunidades virais e bacterianas.
Resultados da investigación: Cocirculación de múltiples virus e bacterias
Achados virais
Os virus detectados pertencían a 21 familias virais, entre elasArenaviridaeeHantaviridae.
A través dede novoMediante o ensamblaxe empregando Megahit, xeráronse 154 contigs virais, dos cales 110 se aliñaron con 19 virus de oito familias.
In Apodemus penínsulae, identificáronse os seguintes virus:
l Arenavirus: virus Lassa, virus Wenzhou, virus Gairo
l Hantavirus: virus Amur, virus Puumala
In Myodes rufocanusDetectáronse arterivirus de rata e virus do Amur.
Entre estes patóxenos:
O virus de Lassa é un axente causante da febre hemorráxica vírica, cunhas taxas de mortalidade que alcanzan aproximadamente o 20 %.
O virus do Amur é un dos patóxenos responsables da febre hemorráxica con síndrome renal (HFRS). A China rexistra a maior carga mundial de infeccións por hantavirus.
Achados bacterianos
Anotáronse un total de 1.051 xéneros bacterianos.
Os xéneros máis abundantes foron:
lSalmonela(26–31%)
lYersinia(11–23%)
Salmonelaé un importante patóxeno transmitido polos alimentos, responsable duns 9 millóns de casos de febre tifoide e aproximadamente 110.000 mortes anuais en todo o mundo.
Yersinia pestis, o axente causante da peste, foi responsable de tres pandemias históricas. A provincia de Heilongjiang está recoñecida como un dos focos naturais de peste da China e segue a ser unha rexión prioritaria para a vixilancia da peste.
Importancia do estudo
Contribucións científicas
Este estudo representa o primeiro informe de fragmentos do virus Lassa e do virus da arterite de rata en roedores de Heilongjiang, o que amplía a base de datos de patóxenos transmitidos por roedores da China.
Caracteriza sistematicamente as comunidades virais e bacterianas nas poboacións locais de roedores, proporcionando datos de referencia para a vixilancia de enfermidades zoonóticas nas rexións fronteirizas.
Implicacións para a saúde pública
Os resultados salientan a necesidade dunha vixilancia continua e dunha detección de patóxenosA. penínsulaeeM. rufocanus.
Os datos proporcionan evidencia científica que apoian as estratexias de control da fonte para enfermidades como a peste e a febre hemorráxica con síndrome renal.
Puntos fortes metodolóxicos
A secuenciación metaxenómica permite a detección imparcial tanto de patóxenos coñecidos como novos.
Neste estudo, a tecnoloxía de enriquecemento de patóxenos de Macro & Micro-Test demostrou un forte rendemento, mellorando eficazmente a detección de patóxenos obxectivo en mostras biolóxicas complexas. Os resultados confirman a súa capacidade para apoiar a identificación de patóxenos de alta sensibilidade na vixilancia da fauna silvestre.
Recomendación de produto
Baseándose na súa aplicación exitosa neste estudo, o kit de enriquecemento de ARN de patóxenos macro e micro recoméndase encarecidamente para a investigación de vixilancia metaxenómica.
Ao reducir eficazmente a depleción dos ácidos nucleicos do hóspede e enriquecer as secuencias microbianas, o kit mellora significativamente a sensibilidade da detección e a calidade dos datos. Representa unha ferramenta esencial para o descubrimento preciso de patóxenos en mostras complexas e proporciona un soporte técnico sólido para a vixilancia da saúde pública, a avaliación do risco zoonótico e a preparación para brotes.
Contact to learn more: marketing@mmtest.com
Data de publicación: 02-03-2026